5月13日10時，在北京市海淀區知春路14號，國家疾病預防控制局正式掛牌。國家疾病預防控制局成立，意味著疾控機構職能從單純預防控制疾病向全面維護和促進全人群健康轉變，新機構將承擔制訂傳染病防控政策等五大職能。

據長安街知事此前報道，從名稱“國家疾病預防控制局”來看，它已是國務院部委管理的國家局，行政級別為副部級。

公開資料顯示，2021年4月28日，國務院任免國家工作人員，任命國家衛生健康委員會副主任王賀勝為國家疾病預防控制局局長。據悉，2020年新冠疫情暴發后，王賀勝曾任湖北省委常委、省疫情防控指揮部副指揮長、省衛健委黨組書記，參與一線疫情防控。

除了一把手的任命外，國務院同時任命國家衛生健康委員會疾病預防控制局局長常繼樂、南京醫科大學校長沈洪兵院士、國家衛生健康委員會應急辦公室（突發公共衛生事件應急指揮中心）孫陽為國家疾病預防控制局副局長。

對于國家疾病預防控制局的成立，中國工程院院士鐘南山此前在接受人民網采訪時曾表示：疾病防控絕對不僅限于醫療衛生領域，而是要覆蓋農業、工業、林業、海洋等各方面，我們需要擴大疾病防控的范圍，從更多角度和層面控制疾病。要做好更多領域的疫病防控工作，需要相關部委淡化個體利益，通力協作。“因此，對于國家疾病預防控制局的成立，我是非常支持并看好的。”